non ho la tua stessa scheda, ma in pratica ho fatto quello che ipotizzi: disattivare dal registro la chiave ATI presente in Run; in questo modo, tutte le funzionalità della scheda sono cmq loadate, tranne quel fastidioso programmino nel system tray che permette di modificare le risoluzioni o gli altri parametri della scheda stessa.
prova a vedere se con questa procedura le funzionalità della tua scheda rimangono invariate, e testa se effettivamente guadagni allo start-up.
io, come detto, ho risolto