Il passaggio da un Office vecchio ad un Office nuovo è un'operazione sempre un po'
rischiosa... in certi casi (non rarissimi) può addirittura non riuscire (soprattutto se il vecchio Office è molto "vissuto").
Vista la "criticità" della disinstallazione di Office, nel tuo caso sarebbe stato forse preferibile provare ad installare il nuovo Office 2013 direttamente "sopra" il vecchio Office 2007 (soprattutto se quest'ultimo l'avevi usato ed aggiornato tramite WU): in questo caso la disintallazione del vecchio Office sarebbe stata "gestita" dal nuovo Office... e magari il risultato finale sarebbe stato migliore.
Sono comunque cose "imprevedibili": è difficile capire quale sia la strada migliore (a parte la formattazione... che in questi casi è sempre la cosa migliore

).