Per caso hai installato qualche app che gestisce le suonerie in modo differente da come lo fa il sistema del telefono?
Ad ogni modo, prova ad andare nelle impostazioni, nelle applicazioni, entrare nella applicazione di WhatsApp, alla voce memoria, cancellando sia la cache che la memoria dell'applicazione. Magari fai prima un backup delle chat, direttamente dalle impostazioni di WhatsApp, onde evitare di perdere i contenuti.
Tieni presente, che una volta cancellate cache e memoria, quando farai partire WhatsApp sarà come se tu lo stessi utilizzando la prima volta, come fosse appena installato. Se non riesce neppure questo, prova a disinstallare e installare di nuovo whatsapp.